Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms