Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms