Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms