Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRN3E7EW58 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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