Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASA4BC9J798 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms