Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms