Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNDIG1LA6NDD5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms