Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A4D1N5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A4D1N5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A4D1N5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A4D1N5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
A4D1N5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
A4D1N5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms