Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM221AA4D161 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms