Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB4A4D0S4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms