Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms