Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms