Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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