Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms