Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RBMY1A1-201ENST00000303902 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RBMY1D-203ENST00000418956 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RBMY1B-203ENST00000619219 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 HKR1-202ENST00000392153 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ZNF610-209ENST00000616431 1772 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RNF138-201ENST00000257190 2071 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 PPWD1-215ENST00000538977 2055 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC027369.1-202ENST00000534734 1330 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.5-201ENST00000356560 281 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RCL1-201ENST00000381728 758 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 KRTAP9-9-201ENST00000394008 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC012462.3-201ENST00000412951 131 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC021016.1-201ENST00000414167 498 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC007359.1-201ENST00000417910 745 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ELF5-203ENST00000429939 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC008175.1-202ENST00000439653 745 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AL031289.1-201ENST00000440100 471 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC093655.1-201ENST00000446187 641 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AL158829.1-201ENST00000449258 478 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 NPAP1P2-201ENST00000456716 1234 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ABCA9-AS1-201ENST00000458677 523 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AF186996.1-201ENST00000466578 1015 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RN7SL318P-201ENST00000471955 297 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RN7SL62P-201ENST00000498506 297 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC116345.1-202ENST00000513379 941 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 OR4B2P-201ENST00000527724 882 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 LRTOMT-216ENST00000539271 570 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AF067845.1-201ENST00000567210 1192 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 HMGN2P46-207ENST00000568669 388 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 RPL23AP86-201ENST00000573796 541 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC003965.1-201ENST00000575693 667 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC125421.2-201ENST00000580370 583 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC018521.3-201ENST00000581213 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 PDLIM1P3-201ENST00000582370 599 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 SATB1-AS1-212ENST00000596152 610 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC078802.1-201ENST00000602879 843 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC010359.1-201ENST00000602982 507 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 C1orf186-208ENST00000603378 614 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.164-201ENST00000620748 331 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AD000813.1-201ENST00000624007 832 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 TRIM37-214ENST00000625984 204 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 NF1P9-202ENST00000629550 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 CBWD1-205ENST00000382389 1807 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 TCF4-241ENST00000568740 2628 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AOAH-208ENST00000612871 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 DYNLRB1-201ENST00000300469 1464 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 TTC39A-212ENST00000447632 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 IL15-202ENST00000320650 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 WDR92-202ENST00000406245 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 ASNSP1-202ENST00000641079 1352 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTGFRP43088 PBLD-207ENST00000495025 1349 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms