Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES2Q9Y543 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms