Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms