Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRAPPC8Q9Y2L5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms