Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM2AQ9Y2K7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM2AQ9Y2K7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms