Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP20Q9Y2K6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms