Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX4Q9Y2E6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms