Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms