Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms