Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1024Q9UPX6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms