Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms