Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCG2Q9UNQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCG2Q9UNQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms