Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms