Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNRF3Q9ULT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNRF3Q9ULT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms