Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN1Q9ULB1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN1Q9ULB1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN1Q9ULB1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN1Q9ULB1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN1Q9ULB1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN1Q9ULB1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN1Q9ULB1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms