Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms