Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms