Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms