Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms