Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5BQ9UGL1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms