Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLKQ9UBT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms