Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC4Q9UBN4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC4Q9UBN4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms