Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFIP11Q9UBB9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms