Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH10Q9P2E7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms