Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGFRNQ9P2B2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms