Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMG20BQ9P0W2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms