Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms