Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMCD1Q9NZU5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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