Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf78Q9NZ63 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf78Q9NZ63 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf78Q9NZ63 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf78Q9NZ63 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf78Q9NZ63 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf78Q9NZ63 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf78Q9NZ63 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms