Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms