Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms