Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms