Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms