Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms