Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCC13Q9NSE7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms