Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms